মূলত বইটি রচিত হয়েছে একজন বইপ্রেমী, ভ্রমণপিপাসু মেষপালক ছেলের স্বপ্ন পূরণের যাত্রা নিয়ে। ছেলেটির নাম সান্তিয়াগো। গল্পের শুরুতেই বর্ণিত আছে মেষপালকের অতি সাধারণ জীবন যাপনের কথা। তার এই সাধারণ জীবন অসাধারণ হয়ে ওঠে একটি স্বপ্ন দেখার পর। সে স্বপ্নে দেখে সুদূর মিশরে তার জন্য অপেক্ষা করছে গুপ্তধন। এই স্বপ্নের ব্যাখ্যা জানার পর সে গুপ্তধনের সন্ধানে যাওয়ার সিদ্ধান্ত নেয়। যেহেতু তার পৃথিবী ভ্রমণের ইচ্ছা ছিলো তাই সে আর বিলম্ব না করে বেরিয়ে পড়ে স্বপ্ন পূরণের লক্ষ্যে। এমন সময় তার পরিচয় হয় নিজেকে সালেমের রাজা দাবী করা এক বৃদ্ধের সাথে যে তাকে হুরিম এবং থুমিম নামক দুটি অমূল্য পাথর দেন। ভেড়ার পাল বিক্রি করে স্বপ্নের পথে যাত্রা করার পরপরই সে ছিনতাইয়ের সম্মুখীন হয় এবং নিজের সব সম্পদ হারিয়ে ফেলে। কিন্তু তাই বলে সে নিজের লক্ষ্য থেকে সরে যায় না। সান্তিয়াগোর এই দৃঢ় মনোবলই ছিলো তার সমস্ত যাত্রার সঙ্গী। সমস্ত সম্পদ হারাবার পর সে এক স্ফটিক ব্যবসায়ীর দোকানে কাজ নেয় এবং এখানে তার বুদ্ধিমত্তার কারণে সেই দোকানদারও উপকৃত হন। অনেকদিন সেখানে কাজ করে প্রয়োজনীয় অর্থ সংগ্রহ করে সে আবার নিজের স্বপ্ন পূরণের লক্ষ্যে যাত্রা শুরু করে। এই যাত্রায় তাকে পাড়ি দিতে হয় দুর্গম সাহারা মরুভূমি। প্রকৃতির ইশারায় এবং নিজের বুদ্ধির সাহায্যে সান্তিয়াগো সাহায্য করে মরুদ্দ্যানে থাকা মানুষদের। এখানে সে তার ভালোবাসার দেখা পায়। ফাতিমা নামক একটি মেয়ের প্রেমে পড়ে সে। এই অবস্থায় সে তার স্বপ্ন এবং ভালোবাসার মধ্যে একটা অদ্ভুত দ্বন্দ্বের মধ্যে পড়ে। কিন্তু ফাতিমা তাকে আশ্বস্ত করে যে ভালোবাসা কখনোই স্বপ্ন পূরনের পথে বাধা হয়ে দাঁড়ায় না। এখানেই তার পরিচয় হয় আলকেমিস্ট নামক একজন লোকের সঙ্গে।
